Tortoise git забирает файлы не из выбранной папки, а из desktop

Поясняю чуть подробнее. Есть проект, он находится, например, в папке на пути desktop/new/project/. Я нажимаю в этой папке ПКМ (правую кнопку мыши), там делаю всякие операции с созданием репозитория и так далее. Проблема заключается в том, что при push`е в github показывается, что я добавил файлы не из project/, а из desktop/new/project/. То есть должны отображаться файлы a.txt, b.cs и так далее, а отображаются прям desktop/new/project/a.txt... Также проблема идёт если я перехожу в любую другую папку. Я снова нажимаю ПКМ, дабы создать новый репозиторий, но у меня остались всё те же ветви, что были и в проекте по адресу desktop/new/project/, а должны отображаться "Git create repository" и прочие пункты. Приятель скачал по той же инструкции как Git, так и Tortoise, но у него всё работает так как надо. Я предполагаю, что где-то есть данные о том, откуда забирать данные гиту (из выбранной папки или из корня компа), но ничего подобного не нашёл в настройках. Буду рад, если кто-нибудь пояснит, в чём может заключаться проблема. Заранее спасибо!