TypeError: argument of type 'int' is not iterable

Интерпретатор сообщает Вам о том, что по типу int нельзя итерироваться. Т.е. тип int -- это не коллекция. Пример коллекций:

[1, 2, 3]

{1:1, 2:2, 3:3}

import collections
c = collections.Counter()

Вам нужно понять, что лежит в message.chat.id и в message.chat.id. Для этого воспользуетесь отладочным выводом

// Telegram bot
control_quantity = {}


print(control_quantity)
print(message)
print(message.chat)
print(message.chat.id)
if message.chat.id in control_quantity:
    control_quantity[message.chat.id] += 1
else:
    control_quantity[message.chat.id] = 1

Скорее всего, Вы обнаружите нестыковки в данных в одном из этих выводов