Как можно сделать обновление программы?

Вот написал я программу. Нашел в ней баги или еще что, нужно сделать обновление. Какие есть варианты обновления? Обновление будет храниться на usb флеш. ОС линукс. Пока у меня только одна мысль shell-скриптом, но может есть более лучшее решение?