Прописать Header в .htaccess только для основного домена, исключая поддомен

Доброго времени суток.

Сервер Litespeed.

Прописав такую строку Header always set X-Frame-Options "SAMEORIGIN" для основного домена, она же выводится и на поддомене, чего я хочу избежать. Как это можно сделать? Я попытался закинуть файл .htaccess в папку с поддоменом, но мне выдало, что такой файл существует (его дата и размер совпадает с тем, что находится в корне основного сайта). Получается, что .htaccess транслируется с основного сайта.