Что из себя представляет создание куба в OpenGL?

вот вам в помощь, довольно толковый и простой учебник

http://www.firststeps.ru/mfc/opengl/opengl1.html

куб - это 6 граней, каждая из которых состоит из 2 треугольников у каждого треугольника свои координаты

чтобы нарисовать куб вы можете

1. отрисовать 12 треугольников со своими координатами
2. отрисовать 1 треугольник, но каждый раз применяя к его 3м вершинам матрицы трансформации, т.е. по сути перемещая треугольник в нужное положение - на выходе всё равно это будет как бы отрисовка 12 треугольников

Смотрел этот туториал и понял что нет какой то определённой функции для работы 3х мерным пространством

ну в общем так и есть :) с оговорками

1. у вас есть модель объекта из файла (в самом простом случае - набор треугольников (т.е. координат [x, y, z] для 3 точек)) или вы его создадите "вручную" или сгенерируете по какому-то алгоритму

2. чтобы переместить куда-то в пространстве эту модель, повернуть ее, растянуть и т.д. вы каждую точку треугольников умножите на матрицу преобразования и получите новую точку

вернее так - вы вычислите эту матрицу, а видеокарта уже сделает всю остальную работу