Как в Python создать формулу в символьном виде, сохранив её в файл?

Можно воспользоваться одним из многочисленных вэб-сервисов для рендеринга изображения формулы на основе LaTeX Markup, например latex codecogs.

Ваш пример, записанный в этой разметке выглядит как:

y_{1} = x^{2}

Сформировать запрос для создания png, например:

http://latex.codecogs.com/png.latex?\dpi{300}&space;\bg_white&space;y_{1}&space;=&space;x^{2}

и сохранить как картинку: