Java. В Intellij IDEA все файлы классов стали файлами .java

Все файлы классов java в Intellij IDEA, которе находятся в папке com.company стали файлами java. До этого они определялись нормально, и компилятор мог запустить как отдельный класс, так и отделный метод из этого класса. Теперь запуск происходит только через Shift+F10 и выполняется всё по порядку с самого начала. Так же перестали выводится подсказки по автозаполнению. Не могу понять, как вернуть всё обратно. Прошу помощи.